日本科学家在生物学上搞出大动静 ,他们在《美国国家科学院院刊》上发了篇论文,揭示了生命生长背后的一个通用规律。这个规律叫全球约束原理,简单说就是不管营养多充足 ,细胞生长总会遇到层层限制,导致速度放缓 。作者是理化学研究所的山岸淳平和东京科学研究所地球生命科学研究所的畠山哲弘,两人合作把这个原理从数学上证明出来 ,还用计算模拟验证了。
这个发现直接挑战了老观点。传统上,微生物生长靠莫诺方程描述,这个方程从1940年代就用上了 ,它假设生长速度随营养浓度增加而升,到饱和就停 。科学家们常把这比作酶动力学里的米氏方程,认为细胞生长就卡在单一反应或营养短缺上,像生产线上的一个瓶颈。但现实数据不完全对得上。现代实验显示 ,即使简单细菌,里面也有几千个代谢反应同时跑 。改氮供应,就能影响碳对生长的作用 ,说明不是单一因素在决定。更关键的是,观测曲线虽单调上升,但边际效果递减 ,不严格符合莫诺形式。
山岸和畠山团队从资源分配角度切入,提出全球约束原理 。核心想法是细胞生长受一个动态网络控制,不是固定瓶颈。当营养从缺到足 ,起初可能是摄取限速,但供应一多,内部其他资源就接棒当限制 ,比如蛋白合成能力 、细胞膜面积、细胞质拥挤度。这些约束一层接一层激活,每层都让额外营养的贡献变小,形成阶段性减速。团队用约束代谢建模和对偶线性规划证明,这单调性和凹性是资源最优分配的必然结果 。证明不只限线性 ,还能推到非线性凸优化,通用性强。
影子价格在这里是关键工具。它算出多耗一单位资源对生长速度的边际影响,全球约束原理证明这个价格随资源可用性升而降 。团队没依赖具体分子细节 ,就抓住了普遍规律。这跟生命系统物理学思路一致,像之前代谢微观经济学的研究,但他们更强调网络效应 ,不纠结单个机制。
为了验证,他们拿大肠杆菌的基因组尺度代谢模型做模拟 。试了三种约束方式:蛋白分配的通量平衡分析、分子拥挤的通量平衡分析 、膜面积的通量平衡分析。结果都显示生长曲线分段线性,每段斜率随葡萄糖可用性增而减 ,正好对上理论预测。多营养交互更亮眼,莫诺方程处理不了这个 。模拟中,降氧或氮供应 ,曲线在高葡萄糖区下移,但初始段斜率不变。这说明早期阶段其实受非焦点资源限。氮限制的化学培养数据支持了,但团队说还需现代技术多做实验严验 。
他们还发明阶梯木桶模型来解释。李比希最小律从1840年提出,用木桶比喻植物生长限最短木条 ,就是最缺资源。经典木桶描述最大生长率,但不解释动力学。新模型把木条改成阶梯状,到特定水位高度 ,额外约束出现,木条扩展,让进一步升高更难 。这就把莫诺的饱和曲线和李比希的限制统一了 ,给生长动力学新视角。模型直观,帮人理解从微生物到植物的共通点。
这个原理的理论价值大,因为它不靠分子生物学细节 ,就提供普适框架 。过去研究常盯特定约束,这次是跳出看整体规律。实际应用潜力也不小。在生物技术里,懂细胞资源分配的全球约束 ,能优化微生物生产系统的营养配方,提高目标产物产量 。比如工业发酵,调整多营养交互,避免浪费。在农业上 ,它指导作物营养管理,不光看单一元素供应,还得算不同元素通过网络的效应 ,提升产量和可持续性。在生态学,能建更稳的系统模型,预测气候变化下生物圈怎么应变 ,比如资源波动对种群的影响 。
团队直言原理有边界。假设是代谢调节已最优,所以某些案子预测可能失效。比如酸或醇高浓度毒性,会破单调性;低生长速率时 ,调节没优化,偏离凹性 。但这些偏差反过来能指出现有模型外因素,帮助诊断。
未来方向他们也指了。一个是连全球约束原理跟种群生长定律 ,得加营养随种群规模变的假设,可能给资源限种群动力学新洞见。另一个是推多营养共同利用的定量定律,既然原理已证任意营养时的凹性,就能建预测模型 。更远看 ,李比希最小律本是为植物提的,他们盼这个框架统一微生物到高等生物的生长理解。把细胞生物学和生态学结合,推动建生命生长极限的普适框架 ,这是复杂生命系统研究的核心。
这项工作解了长期谜题,为什么营养足了生长还减速 。从现象描述跳到原理阐释,是生物学大步。山岸淳平在理化学研究所继续深挖代谢算法 ,畠山哲弘在东京科学研究所扩展到起源和演化。东京科学研究所是2024年10月1日由东京工业大学和东京医科齿科大学合并的,地球生命科学研究所专注地球生命起源,跨学科氛围帮了忙 。理化学研究所的生物系统动力学中心提供计算支持。
发现过程从2024年初起步 ,当时团队审视莫诺和李比希定律的历史。李比希1840年提最小律,影响植物营养学到生态 。莫诺1942年发方程,用在发酵工业。团队目标桥接这些 ,用资源分配视角精炼成生长收益递减的综合理论。模拟中测试膜约束,发现高密度时主导 。证明分步,先设资源优化,再导单调性 ,凹性从影子价格降得来。
全球约束原理还启发看生命起源。地球生命科学研究所使命是研起源和演化,这个原理可能解释早期细胞怎么在限资源下优化生长。团队没夸大,但指出能推到高等植物 ,甚至动物,虽然需更多数据 。
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